JAGURSで扱うデータは，NetCDFのちょっと古いバージョンですが標準フォーマットなので，GMTだけではなくQGISでも表示できるはずです．ということで，やってみました．
まずは，JAGURS用に変換した標高データ（gebco2min.grd）です．レイヤーの追加で，座標参照システムとして，EPSG:4326（WGS84な緯度経度）を選択します．
それだけで，モノクロで表示されます．ただし，水深が正の値なので海が白くなってしまいます．
色を付けるには，プロパティ→スタイルで，レンダータイプを「単バンド疑似カラー」にします．色は，RdYIBuにしてみました．負の値が赤に割り当てられていますが，今は水深が正の値なので反転はさせないでおきます．
可視化結果が以下の通り．色は，，，これが良いと言うわけではないので（お薦めを見つけたら書き直します）自由に選んで下さい．
ここに，計算結果のSD01.zmax.grdをオーバーレイします．レイヤーの追加で同じくEPSG:4326を指定すれば読み込み完了です．このデータは正のデータだけとりあえず見たいので，0から1の間で白から赤にします．
これだと，既に読み込んである地形データが白で上塗りされてしまってもったいない状態です．プロパティ→透過性で，「画面から値を追加」で陸域を透過設定します．また，追加のデータなし値に0を追加して波が届かなかった場所を背景の地形にします．
結局，最大波高の色をYIOrRdにしています．
見やすいとは言い難いですが，以下のようになりました．
まずは，JAGURS用に変換した標高データ（gebco2min.grd）です．レイヤーの追加で，座標参照システムとして，EPSG:4326（WGS84な緯度経度）を選択します．
それだけで，モノクロで表示されます．ただし，水深が正の値なので海が白くなってしまいます．
色を付けるには，プロパティ→スタイルで，レンダータイプを「単バンド疑似カラー」にします．色は，RdYIBuにしてみました．負の値が赤に割り当てられていますが，今は水深が正の値なので反転はさせないでおきます．
可視化結果が以下の通り．色は，，，これが良いと言うわけではないので（お薦めを見つけたら書き直します）自由に選んで下さい．
ここに，計算結果のSD01.zmax.grdをオーバーレイします．レイヤーの追加で同じくEPSG:4326を指定すれば読み込み完了です．このデータは正のデータだけとりあえず見たいので，0から1の間で白から赤にします．
これだと，既に読み込んである地形データが白で上塗りされてしまってもったいない状態です．プロパティ→透過性で，「画面から値を追加」で陸域を透過設定します．また，追加のデータなし値に0を追加して波が届かなかった場所を背景の地形にします．
結局，最大波高の色をYIOrRdにしています．
見やすいとは言い難いですが，以下のようになりました．
